这所学校被安排在波旁宫殿，于1794年12月21日正式开始运转，当时在场的有已经招入的272名学生，以及许多名人，比如福尔科洛瓦、拉格朗日。经过第二轮的考试期，第一届的400名学生被选拔出来，将进行为期三年的数学、物理化学的学习。

1805年，拿破仑一世将学校变为军校，并把学校放到了巴黎圣日内维耶山，安置在原来的Navarre, Tournai和Boncourt三所学校的地址(今天的法国高等教育和科研部)上。拿破仑认为“给那些不是出身富裕家庭的孩子以先进的教育是危险的”，于是他停止了学校的免费制度，制定了高昂的年学费，并修改了入学考试的选拔制度，使得在那些付费的中学学习的经历成为入学必不可少的条件，而这些学校只有那些有产阶级的孩子才能上的起。

1816年4月13日，学校被路易十八通过他的内政部长Vaublanc伯爵以纪律涣散为由解散。1817年1月17日，它又以“皇家综合理工学院”为名重新建立起来。在第二帝国期间，学校的名称是“帝国综合理工学院”。

19世纪中期开始，因为综合理工学院的数学教育十分突出，学校开始被昵称为“X”.。

1970年起，学校不再是军校，但仍隶属于国防部。学校的法国学生在军衔上都是学生军官，然后是军官。学校由一名现役将军领导。1972年起，这所军队的学校被允许招收女性学生。1972年当年有7名女生考进综合理工，其中就有当年的第一名安娜·肖宾奈。1976年，学校搬到了帕莱索的校园，面积186公顷，建筑面积达到了155 000平方米。有3200人在校园工作，其中一半在研究中心。

2009年3月19日，学校的行政会议通过了向校徽中加入“巴黎高科”字样的决定，学校的正式名称仍然不变。

综合理工大学研究中心所属的 7大专业方向的 24个实验室

生物学专业：

生物化学实验室、生物物理实验室;

化学专业：磷化学与导体金属实验室、反应机制实验室、有机合成实验室;

信息学专业：信息学实验室;

数学专业：数学研究中心、应用数学研究中心、成型计算研究中心;

机械学专业：流体动力学实验室、固体机械学实验室、动力气象学实验室;

物理学专业：应用光学实验室、量子光学实验室、高能物理实验室、界面物理与薄膜实验室、冷凝物质物理实验室、电离媒质物理实验室、理论物理研究中心、辐射固体物理实验室、强激光应用实验室;

人文科学和社会学专业：经济学研究中心、应用人种学研究中心、管理学研究中心。

在各式世界大学排行中，《泰晤士报》将巴黎综合理工排在第34位;在上海交大的排名中位居第201位;而巴黎矿业学校的“国际高等教育机构专业排名”则将之排在第14位。在2017年“QS Graduate Employability Rankings 2017：Top 10”世界排名第6，欧洲国家仅次于英国剑桥(排名第5)。

综合理工大学鼓励学生通过各种途径获得经济上的资助(如奖学金、贷款等)，这些经济资助由该学生所在国给予。综合理工大学对一部分学生发放奖学金。

巴黎综合理工大学每届培养500名工程师学生。这些学生一部分是通过入学竞考的预科班学生，另一部分是从普通大学平行进入的大学生。巴黎综合理工学院的入学竞考同高等师范学校的一样，是历史最久、难度最大的竞考之一。1937年以来，学校向经过三年学习合格的学生颁发名为“综合理工学院毕业的工程师”的文凭。从2004年起，综合理工学院的学制为四年。学习四年后毕业的学生将获得第二个文凭，名为“综合理工学院毕业文凭”。除了培养“综合理工人”，学校还培养博士生(从1985年起)和硕士生(从2004年起)。“综合理工人”毕业后大多进入法国或者国际上的私有企业，还有20%的毕业排名优秀的学生选择进入国家高级机关职团。