东京大学部分科系最早可以溯源到灵元天皇时期，学校主体由“东京开成学校”与“东京医学校”在明治维新期间合并改制而成。作为资本主义文明浪潮冲击下的直接产物，东京大学有着举足轻重的历史性地位，它培养了包括1名菲尔兹奖得主、6名沃尔夫奖得主、8名诺贝尔奖得主、16位日本首相、21位(帝国)国会议长在内的一大批学术名家、工商巨子、政经菁英，是日本重要的政商、文化阵地，是日本最高学术殿堂、是亚洲乃至世界最顶尖的科研教育机构之一。  

药学部

只含药学、制药化学两系，附设药用植物园。

农学部

开设农业生物学、农业化学、林业学、水产学、农业经济学、农业工程、兽医学、林产学8系，附设有农场，实习林场、牧场、兽医院、水产实验场、绿地植物实验场等实习实验设施。

工学部

东京大学最庞大的学部，含有23个系109个讲座，几乎覆盖了所有的工程学科，包括土木、机械、电子、船舶、航空、原子能、资源、金属、材料、应用化学、应用物理、计算等领域的众多学科，还设有一个工程基础系，一个原子能工程研究和综合试验场。

经济学部

仅含经济学、经营学两系，附属有日本产业经济研究室。

理学部

设数学、信息科学、物理、天文、地球物理、化学、生物化学、生物科学、地学9系，附属部门有临海实验场、植物园、基本粒子物理国际中心、光谱化学研究中心、地壳化学研究室、天文学教学研究中心等。

法学部

为东京大学历史最老，也是声望很高的学部，为东京大学支下的部门机构，为东京大学所管辖。日本历史上很多政界要人均出自该学部。设有民主、公法、政治学3系，附属部门有外国法文献中心，近代日本法政史资料中心。

文学部

设文学、史学、语言学、行动学4系，附设文化交流、北海文化研究两实习实验部门。该学部亦出过众多名扬日本的文学家、诗人、俳名作家、艺人等明星。

教育学部

设教育学、教育心理学、学校教育、教育行政、体育和健康教育5系，附属学校有中学、高中各一所。

医学部

有医学、健康护理学两系，附设脑研究实验室、医学电子实验室、声音语言医学实验室、实验动物饲养室，两所附属医院，附属学校有养护学校、接生护士学校。该学部以外科，特别是脑外科在世界上十分有名。

1、大学毕业或即将大学毕业。

2、已完成或将要完成16年的学校教育。

3、已完成15年的学校教育，以优异的学习成绩取得了所需学分并获得东京大学研究生院的认可。

4、被东京大学研究生院认可的具有硕士或高于硕士能力的。

东京大学奖学金

东京大学是所历史悠久的著名大学，它保持着传统大学的特征：多学院、多学科。目前全校的学科差不多全是老学科，办学水平很高，几乎所有学科均能授予硕士和博士学位。对新建学科和教学上的改革持慎重的态度，他们认为必须保持学校的一贯传统，不要人云亦云，方能办出高质量和自己的特色。“以质取胜，以质取量”是东京大学的办学目标，全校教职员工是这样认为的：保持学校的稳定和学术上的高水平是维系学校尊严和荣誉所不可缺少的。

因此他们在培养人才方面着眼于高质量，为达到这个目标，他们采取了一些措施：为控制学校规模，不宜把学校办得过大，以维持学校运转的高效率，目前一直把本科学生人数控制在15000人左右;强调大学在搞好教学同时，开展科学研究，多出世界前沿的学术成果;精心选择，建设一支高质量的教授队伍;教学上强调基础知识教育，规定4年制大学生必须有两年时间在教养学部学习共同必修基础课和一部分专业基础课;建立导师带研究生制度，对研究生严格要求，同时充满爱心，悉心指导等等